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由于母婴阻断受到孕妇、医生双方的重视，事实上乙肝病毒的父婴传播的几率比母婴传播还要大，而且更容易造成终身携带。如果父亲是“大三阳”，没有采取任何阻断措施，出生婴儿感染几率可达80%以上，而“小三阳”者，宝宝出生感染几率为20%左右，个别的还会出现低体重儿、先天性疾病或畸形、流产、死胎等。
因为患有乙肝的男性，其精子中可检出乙肝病毒DNA，随着精子进入卵细胞，尽管母亲无肝炎，但这种受精卵在形成胚胎过程中乙肝病毒也在不断增殖，使子代成为乙肝患者或携带者，其传播方式称为父婴传播。
